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FASTQファイルの前処理・クオリティチェックのやり方について詳しく解説！
はじめに前回はFATSQファイルのダウンロードまで行いました。今回は下記の記事の続きとなります。次世代シークエンサーまたは公共データベースから取得したFASTQファイルは、アダプター配列や低品質なリードを含んでいます。したがって、FASTQ
次世代シークエンサーの種類とその原理についてわかりやすく解説！
はじめに本記事では代表的な次世代シークエンサーの種類とその原理についてわかりやすく、そして詳しく解説して行きます。次世代シークエンスを扱う上で必須の知識や用語についても同時に解説していきます。次世代シークエンサーを用いて実験をしたい方やNG
はじめに今回は公共データベースに保存されているsra形式のシークエンスデータをダウンロードし、fastq形式のファイルを取得する方法について、実際の論文データを用いて詳しく解説していきます（図1）。誰でも再現できるように使用するコマンドにつ
公共データを再利用してRNA-seq解析をするために！RNA-seq解析の基礎知識を解説！
はじめに今回は次世代シークエンサー（next-generation sequencer; NGS）を用いたRNA-seq解析の基礎知識について解説します。はじめてRNAseq解析をはじめる方、途中で挫折してしまった方、公共のデータベースを用
はじめにRNA-seq解析では、解析の過程で様々な種類のファイルと解析ツールが登場するので、「それぞれのファイルには何の情報が格納されているのか？」、「どの解析ツールを使えばいいのか？」「次の解析は何をしたらいいのか？」など、初学者がつまず
