ハッシュタグ記事一覧

コロナワクチン

3〜4年ほど前に打ったワクチン注射の跡が時々痛む事が有ります。これも副反応の一つでしょうか？私は六回目で終了しました。<…

2025/05/12 16:49

ずっと下まで相乗効果

コーニングが挙げた相乗効果の例には、多細胞性、有性生殖、暖を取るために身を寄せ合うコウテイペンギンが含まれます。

2024/11/01 08:46

モデナ社、DNA汚染ががんを引き起こす可能性を認める

モデナ社、DNA汚染ががんを引き起こす可能性を認める

2024/10/23 12:45

食と医療の自由を守るためにできる19のステップ

食と医療の自由を守るためにできる19のステップ

2024/07/14 20:31

宇宙物理学者: 「生命が最初にどのようにして、どこで、なぜ出現したのか、我々はまだ知らない」

インテリジェントデザインとのつながりが何もなくても、この論点をこれほど明確に捉えている科学者をまた一人見つけたのは喜ばしいことです。

2024/04/18 15:31

システム生物学が生命の複雑さを解読する — CELSからの報告

クジラの「痕跡的な」骨盤骨という大切にされてきた進化論的物語は、信用を失った進化のイコンの増大する山に加わっています。

2024/02/21 09:09

RNAトランスフェクション

RNAトランスフェクションのページを更新RNAを細胞にトランスフェクトして、コードされたタンパク質を一時的に発現したり、RNAの分解速度を調べることも可能である。RNAトランスフェクションは、分裂しない初代細胞でよく使用される。siRNAをトランスフェクトして、RNAサイレンシング（すなわち、標的遺伝子からのRNAおよびタンパク質の消去）を行うことも可能である。siRNAのトランスフェクトは、特定タンパク質（例えば、エンドセリン-1）の遺伝子ノックダウンの研究に使用され、遺伝子治療の実現に向けて応用が進んでいる。RNAサイレンシングの限界として、細胞に対するトランスフェクションの毒性と、他の遺伝子/タンパク質が発現してしまう潜在的な「オフターゲット」効果がある。＜出典：Wikipedia＞⇒トランスフェク...RNAトランスフェクション

2023/12/19 07:18

デイブ教授の子供じみた嫌がらせと電撃的引用ブラフを暴く

深刻な問題が未解決のままであるかは、時には科学的に掘り下げてみないとわからないことがあるのは事実です。

2023/11/19 07:52

FASTQファイルの前処理・クオリティチェックのやり方について詳しく解説！

はじめに前回はFATSQファイルのダウンロードまで行いました。今回は下記の記事の続きとなります。次世代シークエンサーまたは公共データベースから取得したFASTQファイルは、アダプター配列や低品質なリードを含んでいます。したがって、FASTQ

2023/09/04 23:04

公共データを再利用してRNA-seq解析をするために！RNA-seq解析の基礎知識を解説！

はじめに今回は次世代シークエンサー（next-generation sequencer; NGS）を用いたRNA-seq解析の基礎知識について解説します。はじめてRNAseq解析をはじめる方、途中で挫折してしまった方、公共のデータベースを用

2023/09/03 12:31

次世代シークエンサーの種類とその原理についてわかりやすく解説！

はじめに本記事では代表的な次世代シークエンサーの種類とその原理についてわかりやすく、そして詳しく解説して行きます。次世代シークエンスを扱う上で必須の知識や用語についても同時に解説していきます。次世代シークエンサーを用いて実験をしたい方やNG

2023/09/03 12:30

RNA-seq解析（ドライ解析編）の流れを詳しく解説！

はじめにRNA-seq解析では、解析の過程で様々な種類のファイルと解析ツールが登場するので、「それぞれのファイルには何の情報が格納されているのか？」、「どの解析ツールを使えばいいのか？」「次の解析は何をしたらいいのか？」など、初学者がつまず

2023/09/03 12:29

SRAからFASTQをダウンロードする方法を詳しく解説！

はじめに今回は公共データベースに保存されているsra形式のシークエンスデータをダウンロードし、fastq形式のファイルを取得する方法について、実際の論文データを用いて詳しく解説していきます（図1）。誰でも再現できるように使用するコマンドにつ

2023/09/03 12:29

プロモーター （Promoter）

プロモーター（Promoter）のページを更新プロモーター（Promoter）とはゲノムから遺伝子の転写が行われるときの、転写開始部分として機能している領域のことです。RNA合成の鎖伸長反応に先立ち、それとは独立して開始の段階があります。そのとき転写複合体が開始部位で組み立てられ、短いRNA鎖が合成されます。転写（DNAからRNAを合成する段階）の開始に関与するDNA上の塩基配列です。ここにRNAポリメラーゼ（RNAを合成する酵素）が結合し、転写が開始されます。しかし、転写開始の反応には、さまざまな調節因子が関与しており、それら調節因子の結合配列等も含めて広義の意味で使用されることもあります。転写は原核生物、真核生物ともに1個以上のタンパク質因子がプロモーター配列とRNAポリメラーゼの両方に結合したとき、...プロモーター（Promoter）

2023/06/21 12:39

オリゴヌクレオチド (oligonucleotide)

オリゴヌクレオチド(oligonucleotide)のページを更新数個から20個程度のヌクレオチドが直鎖状に重合したポリヌクレオチド。相補的な塩基対を形成する性質があり、cDNAの検出やポリメラーゼ連鎖反応法（PCR法）のプライマーとして利用される。オリゴヌクレオチド（Oligonucleotide）は、おおよそ20塩基対かそれ以下の長さの短いヌクレオチド（DNAまたはRNA）の配列である。自動合成装置によって、160から200塩基対程度のオリゴヌクレオチドは自動的に合成できる。ヌクレオチドは相補的なヌクレオチドと結合する性質があるので、オリゴヌクレオチドは相補的DNAまたはRNAを検出するプローブとして使われる。そのほかのオリゴヌクレオチドを用いる実験手法としては、DNAマイクロアレイ、サザンブロッティ...オリゴヌクレオチド(oligonucleotide)

2023/05/25 11:58

piRNA

piRNAのページを更新RNAサイレンシング機構のひとつとして知られるpiRNA経路は，動物の生殖巣において，おもにトランスポゾンの発現の抑制に機能する．piRNAは約30塩基の小分子RNAで，配列に相補性のあるトランスポゾンRNAへとPIWIタンパク質をガイドすることにより，転写レベルおよび転写後レベルにおいてその発現を抑制する．piRNA経路にかかわる因子の欠損はトランスポゾンの活性化や配偶子の形成不全をひき起こすことから，piRNA経路は生殖細胞のゲノムの完全性を維持するうえできわめて重要な役割を担うと考えられている．これまでの精力的な研究により，多数の因子が関与する複雑なpiRNA経路の全体像がしだいに明らかにされてきた．ヒトのゲノムの約45％は，トランスポゾンとよばれる転移因子やその残骸からなる...piRNA

2023/05/19 13:40

gRNA (ガイドRNA)

gRNA(ガイドRNA)のページを更新ガイドRNA(gRNA)は、複合体を形成するRNAまたはDNA標的酵素のガイドとして機能するRNAの断片です。非常に多くの場合、これらの酵素は、標的のRNAまたはDNAを削除、挿入、またはその他の方法で変更します。それらは自然に発生し、重要な機能を果たしますが、CRISPR-Cas9やCRISPR-Cas12などのターゲット編集に使用するように設計することもできます。ミトコンドリアに2つのゲノムが存在し、そのうちの1つに、もう1つのゲノムのエラーを修正する配列情報が含まれていることは、目新しいことです。編集は通常、mRNAの3'から5'に進みます。最初の編集イベントは、gRNAが編集部位のすぐ下流で相補的なmRNA配列とRNA二重鎖を形成するときに発生します。これによ...gRNA(ガイドRNA)

2023/05/17 13:18

リボザイム (ribozyme)

リボザイム(ribozyme)のページを更新リボザイム(ribozyme)は、触媒としてはたらくリボ核酸(RNA)のこと。リボ酵素ともよばれる。トーマス・チェック、シドニー・アルトマンによって発見され、両名はこの功績により1989年にノーベル化学賞を受賞した。以前は、生体反応はすべてタンパク質でできた触媒である酵素が制御していると考えられていた。しかし、一部の反応はRNAが制御していることが見出され、これをRNAと酵素(Enzyme)に因んでリボザイムと命名された。リボザイムはテトラヒメナの研究中に見つけられたものである。リボザイムは特定の配列を有するRNA鎖であり、それ単体でRNA自身を切断したり、貼り付けたり、挿入したり、移動したりする活性・能力（自己スプライシング機能）を持っている。つまり、RNAが...リボザイム(ribozyme)

2023/05/15 15:03

tRNA（トランスファーRNA）

tRNA（トランスファーRNA）のページを更新tRNA（トランスファーRNA）は、タンパク質を合成する翻訳の際に、特定のアミノ酸をリボソーム内部へと導入するRNAである。74-93塩基からなる短いRNA鎖である。アミノ酸結合部位と、mRNAのコドンと水素結合を作るためのアンチコドン部位を持つ。非コードRNAの一種である。転移RNAとか運搬RNAとも言われる。通常76-90ヌクレオチド（真核生物の場合）のRNAからなるアダプター分子であり、遺伝情報を含むmRNAとタンパク質のアミノ酸配列とを物理的に結びつける役割を担う。運搬RNA、トランスファーRNAとも呼ばれ、通常tRNAと略記される。かつてはsRNA（solubleRNA）と呼ばれていた。tRNAは、細胞内のリボソームというタンパク質合成機械にアミノ酸...tRNA（トランスファーRNA）

2023/05/06 21:20

RNA（Ribonucleic acid）の種類

RNA（Ribonucleicacid）の種類のページを更新リボ核酸（RNA:Ribonucleicacid）は、リボースを糖成分とする核酸である。リボヌクレオチドが多数重合したもので、一本鎖をなし、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシルの四種の塩基を含む。一般にDNA（デオキシリボ核酸）を鋳型として合成され、その遺伝情報の伝達やタンパク質の合成を行う。生体内では触媒として働いたり，タンパク質の合成に関与するなどの役割を果たしています。タンパク質の合成においては，DNAの情報を仲介してアミノ酸を並べる鋳型になるmRNA（メッセンジャーRNA）と，mRNAの上にアミノ酸を運んでくるtRNA（トランスファーRNA），アミノ酸同士をつなげるリボソームで重要な働きを担うrRNA（リボソーマルRNA）など多くの種類...RNA（Ribonucleicacid）の種類

2023/05/03 22:19

【第2回】DNAとゲノム、染色体、遺伝子の違いとは？

はじめにDNA、ゲノム、染色体、遺伝子、核酸など、生命の設計図を表す用語は複数あります。これらの用語は非常に重要なのですが、正しく理解して説明できる人は少ないのではないでしょうか？本記事ではこれらの違いだけでなく、混乱しやすい内容についても

2023/01/10 19:49

【第1回】DNAとは何か？DNAについて詳しく解説！

はじめにDNAとは生命の設計図です。DNAの異常は癌や自己免疫疾患、感染症など様々な疾患の原因となり得ます。ですので、DNAに関する知識は身体の仕組みを知るためだけでなく、病気のことを理解する上でも非常に重要です。今回は基本的な事項ですので

2023/01/10 19:43

【第6回】RNAはなぜ存在しているのか？RNAの構造、機能を詳しく解説！

はじめに生物の主要構成要素であるタンパク質は、DNAから直接合成されるのではなく、RNAが中間体として使われます。DNAからRNA、RNAからタンパク質という順番で遺伝情報が伝わっていくことをセントラルドグマと言いますが、この流れは有名です

2023/01/07 18:58

RNAの品質チェック【A260/280だけでは不十分】

皆さんはRNAの品質をどう評価していますか？ナノドロップなどで吸光度を測定している方が多いでしょう．でも実は，ナノドロップだけでは不十分です．本記事では，RNAの品質チェック方法をまとめました．

2022/03/19 22:51