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DNA-encoded chemical libraryの将来展望 【核酸・機械学習】
DNA-encoded chemical library (DECL) は核酸や細胞内タンパクに対しても使われるようになってきました。この記事ではその展望をまとめます。
2023/06/15 08:58
ヒット化合物同定を加速するDNA-encoded chemical library
比較的最近になり、創薬においてDNA-encoded chemical library (DECL) 技術が使われるようになりました。この記事ではDECLを概説します。
2023/06/12 08:31
創薬研究に役立つ化合物とタンパクのデータベース 【基本を紹介】
創薬研究においては公開されているデータを効率よく集めるというのがスタート地点になります。本記事では、化合物やタンパクについて、創薬研究の最初の時点でよく使われているデータベースを紹介します。
2022/12/15 06:01
AI創薬用の化合物とタンパクの符号化法 【SMILESやアミノ酸埋め込み】
化合物-タンパク相互作用 (chemical-protein interaction, CPI) 予測モデルを開発するには、化合物とタンパクを数値に変換することがまず必要です。ここでは代表的な手法について紹介します。
2022/12/14 06:19
化合物-タンパク結合予測モデルの改善点 【2022年末時点】
化合物-タンパク相互作用予測をより正確に行うために、まだまだ改善するべき点が残されています。この記事では2022年12月時点での代表的なトピックスを紹介します。
2022/12/13 22:15
深層学習による化合物・タンパク質の相互作用予測【AIによるドッキング】
化合物とタンパクの相互作用 (chemcial-protein-interaction, CPI) を予測する人工知能 (AI) が近年さまざま登場しています。ここではAIの中でも特に深層学習を使った方法を概説します。
2022/12/09 10:07
ヒトT細胞受容体の遺伝子座と構造【2つの染色体上に分かれている】
ヒトのT細胞受容体（TcR）遺伝子は非常に複雑な構造になっています。この記事ではそれらの概要と調べ方を紹介します。
2022/10/12 08:37
次世代シークエンサーでコロナを解読する【手順概説】
次世代シークエンサー (NGS) を使ってウイルスを検出するためにはさまざまなステップがありますが、この記事では各ステップで使われている主要なツールを紹介します。
2022/10/11 17:59
コロナ研究に使われるデータベースやツール【情報科学が支える】
コロナウイルス研究を支えているのは情報科学による解析手法や各種データベースです。この記事では、これまで使われてきたリソースを紹介します。
2022/10/10 18:27
コロナ変異株5種概説【WHOのVariants of Concern】
SARS-CoV-2にはさまざまな変異株があります。この記事ではそれら変異株の中でも特に大事な5つに絞って、どのような変異株なのか概説します。
2022/10/07 09:46
SARS-CoV-2の分類法【変異株の命名ルール解説】
COVID-19の原因となるウイルスSARS-CoV-2はさまざまな変異株があり、それらは独特の名前で呼ばれています。変異株の命名ルールを概説します。
2022/10/06 17:36
T細胞受容体とペプチドの結合を深層学習で紐解く 【TCR-抗原の法則】
T細胞受容体 (TCR) と抗原ペプチドの結合は獲得免疫において重要なステップであり、これまで数多くの免疫学者による実験が行われてきました。機械学習技術の台頭とともに、その結合の予測にも使われるようになってきました。この記事では、特に深層学習による抗原ペプチド結合予測手法を俯瞰します。
2022/10/05 16:30
タンパク質の染色の基本 【CBB/銀染色/蛍光染色】
タンパク質実験の基本的な手技の一つに、タンパクの染色があります。この記事では、代表的な染色方法をとりあげその原理やメリット・デメリットを紹介します。
2022/09/27 05:50
多様なメディカルデータの統合プロジェクト 【世界各国で進む】
データを活用するためには、まずしかるべきデータリポジトリーが必要です。世界各国でそのような取り組みが進んでいますが、その概要をこの記事では紹介します。
2022/09/26 06:38
研究者・学生に薦めたいUdemy動画講座5選
昨今はさまざまなことがオンラインでできるようになりました。今回は生命科学や医療系の研究者を目指す学生さんや、現役の若手研究者の先生方におすすめしたい動画講座をご紹介します。
2022/09/24 17:45
AIによるがん創薬の潮流【新たな治療法の開拓】
がんビッグデータは、新たな治療薬や治療戦略を生み出すためにも使われています。実際、いくつかの薬がAIによって新たながんの治療標的として見つかってきました。この記事ではAIによるがん創薬研究を紹介します。
2022/09/22 09:25
データ解析から見出したがん診断バイオマーカー 【MammaPrint等】
がんに関するさまざまなデータが蓄積するにつれて、そのデータマイニングにより見出した複数遺伝子セットをがん診断に使うという取り組みがなされてきました。この記事では、すでに承認されたバイオマーカーであるMammaPrintやその他のアプローチを紹介します。
2022/09/21 17:35
がん研究を加速するウェブツール
がんゲノムや遺伝子発現データなど、多様なデータが取得可能になりました。それらを手軽に扱えるウェブツールもいろいろ登場したので、本記事で紹介します。
2022/09/20 17:22
がん研究に有用なゲノムやプロテオームリソース
近年のオミクス技術の発達により、がんに関するさまざまなデータが取得されてきました。そこでこの記事では、がん研究者なら絶対に押さえておきたいリソースを紹介します。
2022/09/19 18:16
工場としてのHEK293細胞【293Tやfreestyle等も】
HEK293細胞やその派生細胞株は、培養細胞株の中で最もよく使われているものの1つです。この記事では、ATCCに登録されている代表的な派生株の紹介や、近年の研究から分かってきたことについてまとめます。
2021/07/13 11:22
アメリカ・ソーシャルセキュリティーナンバー (SSN)申請体験談
この記事では、コロナ禍でソーシャルセキュリティーナンバー (SSN) の申請体験談と、SSNがなくても口座・携帯を用意する方法を紹介します。
2021/07/12 11:25
ゲノム編集の核酸デリバリー法 【治療応用への第一歩】
ゲノム編集技術を医療や産業界に応用するためには、どのようにしてそのシステムを目的の細胞に届けるか (デリバリー) を考えないといけません。この記事では、これまで行われてきたさまざまなデリバリー方法のうち、代表的なものを紹介します。
2020/12/09 17:50
CRISPRによる部位特異的なRNA塩基編集 【A-to-IとC-to-U】
RNA塩基編集にはDNA塩基編集にはない利点があります。この記事では、部位特異的なRNA塩基編集を誘導する方法と文献を紹介します。
2020/12/08 16:30
2020年11月 【アクセスランキング】
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 11月は3万ほどアクセスがありました。この記事では、2020年11月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~
2020/12/01 21:37
DockerでJupyter notebookを使う方法 【たった1行で起動できる】
バイオデータ解析になくてはならないJupyterNotebookを、Dockerから起動する方法をまとめています。面倒な環境構築は不要で、1行で使うことができます
2020/12/01 18:20
CRISPRによるDNA塩基編集 【CBEとABE】
CRISPRを使うと、DNAを切断することなくDNAの1塩基置換を行うことができます。この記事では、base editorの基本を解説しています。
2020/11/30 16:42
多細胞モデル生物としての線虫 【遺伝子から個体レベルまで】
線虫 (c. elegans) とは体長 1mm程度の小さな虫ですが、これまで何度もノーベル賞につながる大きな研究成果を生み出しています。モデル生物としての有用性について解説します。
2020/11/29 09:36
がんの体細胞変異 (somatic mutation) を解釈する 【リソースを紹介】
がんの変異遺伝子を解釈するウェブツールをまとめました。プログラミングができなくても、ブラウザから簡単に調べることができます。
2020/11/26 16:12
大腸菌の大きさと重さ 【サイズと増殖スピードは関係する】
大腸菌は生物学における「定規」として使うこともできます。この記事では、大腸菌の大きさやサイズについて掘り下げて解説していきます。
2020/11/25 16:56
実験に使う大腸菌K-12株と枯草菌の歴史 【モデル原核生物】
生命医学研究において大きな貢献をしてきたモデル微生物は、大腸菌と枯草菌です。この記事ではこれら2種類の歴史とツールを紹介しています。
2020/11/20 15:55
遺伝子組換え実験の物理的封じ込めと大臣確認実験 【P1, P2, P3の意味】
遺伝子組み換え実験の基本となる物理的封じ込めについて、分かりやすい言葉で学生さん向けに重要事項をまとめました。
2020/11/19 16:26
救急医療の値段 【時間外の病院は急病のときのみOK】
この記事では救急外来を受診するといくらかかるのかをまとめました。これを読んで、「日中は都合が悪い」という理由で夜間に受診する方が減るといいなと思っています。
2020/11/05 17:48
リン酸カルシウム法によるトランスフェクション 【圧倒的に安い】
プラスミドDNAを細胞の中に入れるトランスフェクション法にはさまざまな方法があります。この記事では、そのうち最も古くからあるリン酸カルシウム法についてまとめます。
2020/11/04 17:12
2020年10月 【アクセスランキング】
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 10月は3万ほどアクセスがありました。この記事では、2020年10月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~
2020/11/01 05:45
リポフェクション法の原理の概略と試薬・プロトコールの例【トランスフェクションの基本】
細胞に遺伝子導入をする方法はさまざまなアプローチがあります。この記事では、そのうち最もよく使われているリポフェクション法について、その原理の概略とプロトコルの例について紹介します。
2020/10/31 08:14
はじめてのRNA-seqをやる前に 【シークエンサーのしくみとデータ登録】
RNA-seqは今やほとんどの生命科学研究に使われていると過言ではありません。この記事では、これからRNA-seqを始めようという方に向けて、シークエンサーの基本的なしくみや設定の目安をまとめています。
2020/10/30 06:16
はじめてのRNA-seqをやる前に 【RNA抽出~サンプル調製の概略】
この記事では、RNA-seqを今から始めたい方が知っておかないといけない基礎中の基礎をまとめていきます。
2020/10/29 17:59
PythonのSymPyで微分方程式を解く方法 【ロトカヴォルテラを題材に】
SymPyを使えば簡単に数式展開もできます。この記事では、SymPyで微分方程式を解く方法を、数理生物学の基本の1つであるロトカヴォルテラ方程式を題材にコード付きで紹介します。
2020/10/26 08:44
女性研究者向けの科学賞【研究助成も解説】
女性研究者はもともと男性に比べて少なく、さらに妊娠・出産をする場合にはどうしても研究者のキャリアにブランクができてしまいます。この記事では、女性研究者を支援する賞や助成について紹介します。
2020/10/24 08:41
大腸菌の遺伝子型 【意味と読み方の例】
遺伝子操作をするためには、大腸菌内のベクターが安定していることが不可欠ですが、そのために改良された大腸菌が使われてきました。この記事では大腸菌の遺伝子型の読み方を、学部学生さん向けに解説します。
2020/10/23 06:35
哺乳類細胞へのトランスフェクション法5種類 【原理の概要】
ヒトやマウスなどの真核生物細胞へ遺伝子を入れる (トランスフェクション) 法には、いくつか種類があります。 この記事では、それらの方法について概略をまとめます。
2020/10/22 08:02
トランスポゾンの発見とトウモロコシ 【1983年ノーベル医学賞解説】
1983年にノーベル賞を受賞したバーバラ・マクリントックは、長年トウモロコシを観察し、「動く遺伝子」という概念を世界ではじめて提唱した女性科学者です。この記事では彼女の人生とその発見について紹介します。
2020/10/21 05:21
生活習慣病と遺伝子型のデータ 【Metabolic Disease Portalの紹介】
メタボロームに関係する疾患は、生活習慣の変化もあって世界的に増えています。この記事では、遺伝子型とメタボローム関連病の関係についてのデータベースを紹介します。
2020/10/20 05:47
T細胞以外へのCARの応用 【自己免疫疾患にも有効】
T細胞を改変しがんの治療に使うという取り組みがCAR-Tですが、実はT細胞以外の免疫細胞を改変したり他の疾患にも使うという試みが増えています。この記事ではそうした挑戦をまとめます。
2020/10/19 08:47
超ラジオ体操の効果と注意点を解説 【NHK朝イチで紹介】
誰もが知っているラジオ体操第1は、3分程で健康増進ができる優れた体操です。この記事では、ラジオ体操第1をさらにアレンジした超ラジオ体操を紹介します。
2020/10/17 08:06
Rによるヒートマップの作り方 【遺伝子クラスタリング・色の変更も】
生命科学・医学研究ではヒートマップを書くことは少なくありません。この記事では、Rを使ってヒートマップを書く実際の手順を紹介します。
2020/10/16 06:59
危険な試薬のマーク【劇薬・劇物・毒薬・毒物の違いも】
実験で使う試薬の中には，危険な物質も少なくなりません。そのような物質は、厳重に管理されています。この記事では、毒薬と劇薬の違いや、安全に関わる区分法についてまとめます。
2020/10/15 09:02
エイズウイルスの発見 【2008年ノーベル医学賞解説】
2008年のノーベル医学生理学賞は、病気を引き起こすウイルスHPVとHIVを見つけた科学者に贈られました。この記事ではエイズやHIVの発見についてまとめます。
2020/10/14 09:07
NGS生データの登録方法の概要 【DDBJの例】
論文を投稿するときには、そのデータを公共データベースに登録することが要求されます。この記事ではDDBJ-DRAにfastqファイルを登録する方法の概要について紹介します。
2020/10/13 21:46
CAR-T療法の研究開発を俯瞰する 【現状と課題】
がんの免疫療法で研究が進みつつある分野としてCAR-Tによる細胞治療もあります。この記事ではCAR-T細胞の研究開発について紹介します。
2020/10/12 09:55
ColabとGoogle Drive、GCSの読み込み法 【手順を解説】
この記事では、Google Colabをハブにして、Googleが運営する他のサービス、具体的にはGoogle Cloud Storage (GCS)とGoogle Driveの連携について紹介します。
2020/10/10 08:16
細胞周期をシミュレーションする 【CellDesigner使い方入門】
この記事では、細胞周期がいかにロバストかを、CellDesignerというソフトを使って実際にシミュレーションして確かめてみます。
2020/10/09 08:58
iDEPによるwebベースのRNA-seq解析【初心者でも安心】
RNA-seq解析は今や多くの生命科学研究に取り入れられています。このデータ解析を手助けしてくれるwebツール, iDEPについて紹介します。
2020/10/07 05:56
2020ノーベル医学生理学賞【C型肝炎ウイルスの発見】
2020年のノーベル医学生理学賞はに対して贈られました。この記事ではその概要を解説します。
2020/10/05 19:16
限度額適用認定証と高額療養費貸付制度 【高額な医療費でも大丈夫】
医療費が高額になってしまった場合、一時的にでもお金を用意する必要が出てきます。そんなときに使える2つの公的制度を紹介します。
2020/10/05 09:27
30代までの研究助成や賞 【若手向け生命医学研究助成一覧】
研究費を助成してくれる団体は数多くあります。この記事では、若手研究者しか応募できないものに限って代表的なものをまとめます。
2020/10/03 14:18
遺伝子改変マウス作製の歴史 【2007年ノーベル医学賞解説】
2007年のノーベル医学生理学賞は遺伝子改変マウスの作製に対して贈られました。マリオ・カペッキーの波乱万丈の人生とともに、その歴史を解説します。
2020/10/02 06:06
2020年9月 【アクセスランキング】
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 9月は2万5千ほどアクセスがありました。この記事では、2020年9月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~
2020/10/01 21:59
高額療養費制度の概要 【年収別限度額計算の実例つき】
保険診療では、自分が負担するのは医療費の一部だですが、長期間に及ぶ治療や、手術を行った場合などには金銭的負担は少なくありません。 もし医療費が高額になってしまった場合、ある一定額を超えた部分については
2020/10/01 08:07
対話型AIによる次世代のがんオミクス解析 【DrBioRightの登場】
これまで多数のバイオインフォマティクスツールが開発されてきましたが、ついに対話型AIによるがん解析ツールDrBioRightが登場しました。この記事ではDrBioRightについて紹介します。
2020/09/30 06:02
HTAN: Human Tumor Atlas Network 【2020年代の国際がんプロジェクト】
がんに関する国際的なプロジェクトはこれまでいくつか行われてきましたが、今あたらしいプロジェクトが始動しています。この記事ではHuman Tumor Atlas Networkプロジェクトについて紹介します。
2020/09/29 06:31
短い短報論文を投稿できる一流誌 【図は2つだけ】
生命科学の論文には多くの場合複数の図がありますが、中には短い論文もあります。この記事では、超短報を投稿できる一流誌を紹介します。
2020/09/28 06:34
日本の学生向けの科学の賞・コンクールまとめ 【小・中学生, 高校生から大学院生まで】
多くの団体がそれぞれが趣向を凝らした科学コンクールや奨励賞を用意しています。この記事では、小学生から大学院生までの学生の方々が挑戦できるコンクールや賞をまとめます。
2020/09/26 08:27
細胞周期・チェックポイントの解明 【2001年ノーベル医学賞を解説】
この記事では、細胞周期に関する研究で2001年のノーベル生理学医学賞を受賞した研究者を中心に、その研究の経緯を紹介します。
2020/09/25 07:23
睡眠サイクルから学ぶ理想の睡眠時間 【お役立ちアイテムも】
睡眠で悩む方は少なくありません。この記事では、睡眠サイクルと理想的な睡眠時間を確保するアイテムを紹介します。
2020/09/24 08:29
ゲノムマイニングで新たな化合物を発見する 【ツールと実例】
ゲノム情報から新たな有用物質を見つけ出す試みも盛んに行われています。この記事では、代表的なツールと実例を紹介します。
2020/09/23 14:29
初めての科研費の注意点 【区分の決め方も】
研究を行うには研究費がかかります。国の科研費は最も大きな公募事業の1つです。この記事では、はじめて科研費を出す方に向けた、よくある疑問をまとめます。
2020/09/22 06:19
初期研修医にオススメのスマホアプリ 【若手医師にも便利】
医療の知識は膨大であり、必要に応じて調べていく必要があります。この記事では、主に研修医の先生が入れておくと便利なスマホアプリを紹介しています。
2020/09/09 06:20
迅速ライゲーション・トランスフォーメーションの方法 【日常のDNAワークをより速く】
生命科学研究のルーチンの1つはライゲーションとトランスフォーメーションです。この記事では、これらを典型的な方法よりも迅速に行う工夫を紹介します。
2020/08/21 08:51
ボイルミニプレップによるプラスミド抽出 【大量サンプルの時に便利】
ボイル法によるプラスミド抽出は、1種類の試薬で完結し、アルカリSDSによるミニプレップより速いというメリットもあります。この記事では、ボイルミニプレップの方法について紹介します。
2020/08/20 08:15
迅速アルカリミニプレップ法の原理とプロトコル 【フェノール不要】
プラスミドのコンストラクト構築とその抽出は生命科学研究の基本です。この記事ではプラスミド抽出の簡単な原理とプロトコル、注意点をまとめます。
2020/08/19 07:05
感染症のSIRモデル発展編 【数理モデルの拡張】
感染症の広がりをシミュレーションするSIRモデルには発展型があります。この記事では、もう少し複雑なモデルについてシミュレーションコードとともに紹介します。
2020/08/18 08:29
感染症のSIRモデル入門編 【シミュレーションコードあり】
感染症の広がり方を予測する代表的な数理モデルがSIRモデルです。この記事では、SIRモデルの基本を説明し、pythonによるシミュレーション例を示します。
2020/08/17 05:44
生命科学実験における再利用のススメ 【日常的なルーチン3つ】
研究の予算は限られています。この記事では、日常的によく行われている実験のうち、再利用して何回も使うことでゴミも研究費も減らせるアイデア3つを紹介します。
2020/08/13 08:40
ENCODE projectの概要 【ゲノム・遺伝子を解き明かす】
ENCODEは、2003年に開始した国際的なヒトゲノム解析プロジェクトで、ヒトゲノムのすべての機能要素の解析をめざしています。この記事では、フェーズIからIIIまでの概略についてまとめます。
2020/08/12 06:32
抗がん剤の感受性を予測する 【機械学習方法とリソース】
抗がん剤がどれくらい効くのか、を機械学習で予測する方法も開発されてきています。この記事では、そういった手法の概要やリソースについて紹介します。
2020/08/11 09:18
研究能力の評価指標10選 【研究者の戦闘力】
研究職のポジションや研究資金配分をめぐる競争に使用されるさまざまな研究能力指標があります。この記事では、インパクトファクターやh-indexだけではないさまざまな指標について紹介します。
2020/08/08 13:54
Pythonでggplot2を使って可視化する 【plotnine入門】
Rにはデータの可視化をするためのライブラリーであるggplot2があり広く使われていますが、Pythonからでもggplot2が使えます。この記事ではplotnineというパッケージを紹介し、Pythonでggplot2を使う方法を紹介します。
2020/08/07 09:38
ヌクレアーゼの種類と基質 【分子生物学研究で使う】
ヌクレアーゼは核酸分解酵素の総称です。自然界にはさまざまなヌクレアーゼがありますが、特に分子生物学研究でよく使われているものは限られています。この記事では、実験でよく使われる代表的なヌクレアーゼについて紹介します。
2020/08/06 09:51
PSI-BLASTでホモログ配列を検索する【PSSMやProfileの計算法も】
遠いホモログ配列を感度良く検出する方法がPSI-BLASTです。この記事では、PSI-BLASTの基盤となっているPSSMやProfileの計算法について簡単に紹介した後、実際にPSI-BLASTを使っていきます。
2020/08/04 08:07
薬物動態をシミュレーションする方法 【Rで簡単に計算できる】
薬物動態の適切なシミュレーションは、治療の基本です。この記事では統計ソフトRのlinpkパッケージを使って簡単に薬物動態をシミュレーションする方法について紹介します。
2020/08/03 07:00
2020年7月 【アクセスランキング】
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 7月は2万ちょっとアクセスがありました。この記事では、2020年7月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~
2020/08/02 10:21
海外のデータサイエンスブログ10選 【最新情報・スキルを身につける】
ビッグデータや人工知能など、データサイエンスの重要性はますます高まっています。この記事では、データサイエンスの情報源になる、海外の良質なブログを紹介します。
2020/07/23 07:00
オートクレーブ滅菌と乾熱滅菌の使い方 【注意点とアルミホイルの意味も】
オートクレーブは生命科学実験でも医療器具にも広く使われている代表的な滅菌法です。この記事では、オートクレーブと乾熱滅菌のやり方や注意点についてまとめました。
2020/07/22 07:00
SWISS-MODELの使い方 【タンパクホモロジーモデリング入門】
似たようなタンパク質の既知の構造を使って未知のタンパク立体構造を予測するホモロジーモデリングを行う代表的なツールSWISS-MODELを紹介します。 この記事ではSWISS-MODELの使い方を実際の解析例とともに紹介します。
2020/07/21 07:00
1コンパートメントモデルと消失速度定数 【簡単に薬物動態を計算する】
薬物がどれくらいの速度で血中から消失していくのかの大きな指標になるのが、消失速度定数と生物学的半減期です。この記事では、複雑な体内を非常に単純化したコンパートメントモデルを紹介し、生物学的半減期を計算する方法について見ていきます。
2020/07/20 11:55
分布容積と組織移行性を分かりやすく 【計算方法と小さい・大きいの目安】
薬が全身の臓器にどれくらい移行するのかを知る1つの指標が分布容積 (Vd)です。この記事では医療系の学生さんに向けて、実際の添付文書の例を挙げて分布容積の意味と組織移行性の目安を紹介します。
2020/07/17 06:27
プラスチックのオートクレーブ可能・不可能の見分け方 【生命科学実験の初歩】
この記事では、生命医学研究によく使われているプラスチックや、その扱いについてまとめます。特に、オートクレーブ可能なのか、不可能なのかを間違えないようにしましょう。
2020/07/16 08:36
安定なタンパク質をデザインする5つの方法 【知っておきたい基本のルール】
タンパク質を改変する際、安定なタンパクをデザインするためにはいくつか基本のルールがあります。この記事では、タンパク工学の基本的なルールを5つ紹介します。
2020/07/15 06:23
生命科学のためのLinuxシェルコマンドの基本2【パイプとコマンド置換】
生命科学研究のためのLinuxシェルコマンド、今回は複数のコマンドを連結するパイプとコマンド置換を中心に、ファイルの移動・コピーをするコマンドや、検索をするgrepコマンドなどを紹介していきます。
2020/07/14 06:20
生命医学系学術誌の最新インパクトファクターとその傾向 【2020年6月最新版】
研究成果を論文として発表する時に、どの学術誌に投稿するか考慮する際の指標の1つがインパクトファクターです。この記事では、代表的な学術誌を中心に最新版のインパクトファクターを紹介します。
2020/07/13 08:00
Google Colab Proを日本から使う方法 【コスパの比較もあり】
ウェブブラウザさえあればどこからでも手軽に使えるGoogleのColaboratory (Colab) が、よりパワーアップしColab Proという名前で登場しました。この記事ではColab Proを日本から使う方法についてまとめます。
2020/07/10 06:12
生命科学のためのLinuxシェルコマンドの基本1 【リダイレクトとオプション】
バイオインフォマティクス解析を行う時には、Linuxベースのコマンドを使うことが避けて通れません。この記事では、ファイルに出力する方法とコマンドのオプションについて最低限をまとめます。
2020/07/09 08:17
生命科学実験プロトコルの探し方 【まずここを探す】
生命科学・基礎医学系のプロジェクトをスタートするとき、実験プロトコルを作るところからということも多いです。この記事では、生命科学プロトコル、特に分子細胞生物学領域のプロトコルの探し方について解説します。
2020/07/08 06:13
バイオ研究のためのLinuxシェルコマンド超入門 【まずはこの6コマンドから】
バイオインフォマティクス解析を行う時には、Linuxベースのコマンドを使うことが避けて通れません。この記事ではLinuxコマンド入門について、これまでデータ解析に馴染みがない方に向けて紹介します。
2020/07/07 06:24
2Aペプチドの原理と長所 【IRESとの違いも】
IRESや2Aペプチドを使えば、1つのmRNAから複数のタンパクを発現させることができます。この記事ではIRESを簡単に紹介してから、2Aペプチドの原理やメリットについてまとめます。
2020/07/06 06:30
K-meansクラスタリングとDBSCAN クラスタリングの比較例 【Pythonコードとエルボー法も】
クラスタリングには代表的な方法がいくつか知られていますが、この記事ではkmeans法を中心にしてクラスター数を自動で判定するエルボー法も含めて紹介します。
2020/07/04 21:59
2020年6月 【アクセスランキング】
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 6月は1万5千強のアクセスがありました。この記事では、2020年6月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~
2020/07/02 21:47
NCBI Genome Data Viewerの使い方 【バイオデータベース解説シリーズ】
NCBIは生命科学系のさまざまなデータを集積していますが、その公式のゲノムビューワーがGenome Data Viewerです。この記事では、Genome Data Viewerの使い方をいくつかの例とともに紹介します。
2020/06/02 10:00
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