とある生物系研究者によるサイエンスブログ

Ubuntu16.04 に minergate をインストールする

サイエンスに関係のない自分メモ。 最近流行りの仮想通貨マイニングの便利ツールである、minergate を ubuntu16.04 にインストールしたメモ。 マイニングツールの中でも特に幅広いプラットフォームで簡単にマイニング環境を作成できる便利ツールである minergate を ubuntu16.04 インストールしてみました。 こちら https://minergate.com/downloads/gui

2017/07/31 23:32

Ubuntu で遅延のない Bluetooth イヤホン環境 〜 aptX 対応？

またまたサイエンスに関係ない記事。 以前からデスクトップ環境は Ubuntu (16.04) にしているのですが、イヤホンを無線にしたくなり、いろいろ調べました。結論としては aptX が使えたかはわからないが、遅延はなかったという話になります。 Bluetooth イヤホンは音質が落ちたり遅延したりすることはよく言われています。 それを軽減するためには、例えば aptX というコーデック対応機器を揃えるなどの…

2017/07/20 14:12

ImageJ でスケールバーを入れる方法

ImageJ ではスケールバーを画像に埋め込むことができます。 そのためにはまず、スケールの数値をImageJに教える必要があります。 Analyze > Set Scale Distance in pixels : 画像のpixelサイズ、または任意のピクセル数を入れます。 Known distance : 上で記入したpixelあたりの長さを入れます。 Unit of length : Known distance の単位を入れます。 Global : チェックを入れると開くすべての画像に対して上記の設定…

2017/07/19 23:10

病気に関わるところがピックアップされてしまうのは悲しい 小児難病の貧血、原因遺伝子を発見 京大グループ という記事について

小児難病の貧血、原因遺伝子を発見 京大グループ という記事がyahooニュースに出ていました。 ファンコニ貧血の新規の原因遺伝子が見つかったということで、とてもよい話です。 しかし、このニュースで紹介されている稲野将二郎さんのメインの仕事 (論文) はおそらくこれではありません。 ファンコニ貧血の原因遺伝…

2017/07/14 09:45

ImageJで細胞や核内のシグナルを半自動定量

前回の記事で細胞の自動カウント方法を書きました。 しかし、実際の細胞のカウントでは、核の数を数えたい場合だけではなく、核が染色されるマーカーと組み合わせて数を数えたいなどの場合が多いです。 じゃあそっちのシグナルで Analyze Particleすればいいんじゃないの？と思うかもしれないですが、核の形に強いシグナルを示す細胞だけがある場合はそれでいいかもしれませんが、薄いシグナルを示す細胞もたくさんある、…

2017/05/26 13:22

ImageJで細胞を自動カウント

細胞をカウントするというのは細胞や個体を扱う生物学系の研究でとてもよくある作業です。 過去記事では手動カウントするときに便利な機能を紹介しました。 しかし、やはり手作業でカウントするのは非常に面倒くさい。 そこで自動カウンティング方法を紹介しておきます。 これはanalyze particleプラグインを用いた…

2017/05/26 11:55

100記事目を迎えた雑感

休止して、再開してを繰り返していたけれど、ついに100記事目になりました。 最初は純粋に論文の論文の紹介ブログにしようと思っていたんですけど、 科学ニュースの記事について軽く触れる記事を書いたり、 ラボ生活に関することを書いたり、 画像解析ソフトについて書いたり、 実験のtipsを書いたり、 まとまりのない感じですが、 一応論文紹介が半分以上を占めています。

2017/05/20 01:25

ImageJでオリンパス顕微鏡のファイルを読み込む

顕微鏡画像を取得したあとは、適切な画像ファイルにして整理、保管、データ化しなければなりません。 しかし、面倒なのは、顕微鏡会社ごとに顕微鏡画像のファイル形式が異なっていることです。 基本的に顕微鏡画像は、画像を取得した時の顕微鏡のセッティング情報などとひとまとめになった形式になっており、ライカであれば .lif オリンパスであれば.orf といった独自の拡張子になっています。 そのため、顕微鏡をしよ…

2017/05/17 02:00

Nixnote2 beta 8 で初回同期できないときの解決法

Evernote で ノートをとったりしているのですが、サブ機はlinux(Lubuntu 16.04)なのでEvernoteの純正アプリは使用できないので、Nixnote2をインストールしてみました。 Nixnote2 の最新版が beta 8 だったので公式サイトから、ダウンロードしてインストールしました。

2016/09/06 12:29

体外受精に使う培養液が重要らしい

＜体外受精＞培養液の種類で出生児の体重に影響 体外受精するとき何日か受精卵を培養するんですが、そのとき使う培養液の違いによって、出生時の体重に平均158グラムの差があり、出産率も6％程度の違いが出たとのこと。

2016/09/03 10:00

アルツハイマー病の画期的新薬？抗体Aducanumabが効果を上げているらしい

アルツハイマー病は認知機能低下、人格の変化を主な症状とする認知症の一種であり、認知症の60-70%を占めます。(Wikipedia) これまでも様々な薬が生み出されていましたが、効果的な治療薬が見つかっていませんでした。 なぜならば、アルツハイマーでは神経がおかしくなっていること…

2016/09/02 23:06

Windows10とLubuntu14.04でマウスとキーボードを共有する

Windows10とLubuntu14.04でマウスとキーボードを共有するにはSynergyが便利そうだったので導入してみたメモ WindowsにつないだマウスとキーボードをLubuntuでも使えるようにしました。 まずWindows側から Synergyは現在有料ですが、Nightly Built版を使えば無料で使用できます。 ダウンロードページ 自分の環境に合わせて、Windows-x86またはx64.msiを選んで…

2016/08/26 13:40

蛍光の漏れこみを調べるサイトが便利

分子生物学をやっていると蛍光タンパク質や蛍光試薬を用いて、様々な評価をすることがよくあります。 多くの場合蛍光波長の違ういくつかの蛍光物質を組み合わせて2重、3重、4重・・・に評価することで細胞や細胞内のいろいろなものの挙動を調べます。 そのとき問題となるのは傾向の漏れこみです。それを調べる便利なサイトがあるよ、という話です。 蛍光物質の性質 蛍光物質には、励起波長と蛍光波長があり…

2016/08/21 23:36

ゲームや漫画を読んでも近視になりやすい子となりにくい子がいることが科学的に示された

近視は遺伝することはよく知られています。 しかし、遺伝することが分かっているにもかかわらず、原因となる遺伝子についてはよくわかっていませんでした。 今回筆者らは新たな原因遺伝子候補として、APLP2というものを見つけました。

2016/08/17 00:49

ダイエットは体重を5%減らせば十分だった！

肥満になると脳卒中などの心血管疾患になるリスクが上昇したり、インシュリン抵抗性やβ細胞の機能障害を介して糖尿病になったりします。 そうした病気を予防するためには体重を減らす＝ダイエットが効果的であることはわかっていました。 しかし、どの程度体重を減らせばいいのかはよくわかっていませんでした。 今回の論文でわかったことは、たった5%体重を減らせば、十分な予防効果があるということです。

2016/08/15 15:47