コンパニオン診断薬やopenPCRの話

今日は実験しつつ，大学院の課題を少し進めた． コンパニオン診断薬という言葉を聞いたことがあるだろうか． 分子標的薬と同時に開発が推奨される診断薬で， 遺伝子変異を検出するものだ． 例えば，イレッサ®（ゲフィチニブ）であれば，EGFR遺伝子変異陽性の患者に 適応が限られ，遺伝子検査が必要だ． 最近では抗メラノーマ，ゼルボラフ®（ベムラフェニブ）と同時にコバスという BRAF-V600E遺伝子変異の検査薬が同時に発売されている． このような変異を調べるよう各自課題を与えられたわけだが， 遺伝子について調べていくうちに寄り道してしまった． 今や目的の遺伝子の配列は簡単に検索でき，プライマーの設計も簡…

スターラーを自作してみよう1

実はこっそりスターラーを作ってやろうかと考え中 実験室で使用者も増えてきたし，壊れたものも一台ある． それの修理もしてみたい． こういうのは遊びだから，実験から帰った深夜にこっそり自分の部屋でやるのがよい． 博士課程も2年目になり，当初の論文量産計画（謎）も捨て去り， 今は失敗を楽しめるようになった． 悟りを開いたのか笑（単にサボっているだけかもしれないが） さて，マグネティック・スターラーの自作だが， 調べてみると楽勝でヒットする． 下記のサイトがおしゃれに作ってあるので，参考になりそうだ． 意外にも構造は単純で，磁石とそれを回転させるモータ， それとつまみで抵抗を変えられる可変抵抗というア…

博士課程同士の会話

うちの大学は夜9時以降は裏口から出ることになっているのだが、その際に帳簿に名前を書かなければいけない。 学年の欄にDが並んでると、ほっとする 明日も頑張ろうと思える． 一緒に実験してるわけでもないし，昼ご飯も重ならない． 直接、話す機会がそんなにあるわけじゃないけれど、朝早い時間や夜遅くにたまに会うと嬉しくなる。 互いに近況を話すこともあるけれど， 話を聞いているようでどこか自分のことを考えてたりする。 今日もそんな感じだった． 聞いてないように見えても，別に咎めたりしない． 「あー，考えているのだな．そっとしておこう」と思う． さー、明日も早く起きて、仕事前に実験しよう。 失敗を後から見ると…

近況報告

2月から実に半年近く更新をサボってしまった． 近況としては，7月〆切の学会へ向けて，データの取り直しをしているところです． 粉体の粒子径を訳あって小さくしたところ，あまりに上手く行かなかったので， 既存の装置を捨て，新たに装置を考案（大げさに書いたが，既存の装置の使い方を変えただけ）しました． これがなかなか上手く行きそうで，よいデータがとれたのですが， 先生に見せるとやはり，怪しいところがチラホラありました． やはり，学会に発表するのだから， 後になってSTAP細胞ありませんでしたではダメなわけで， ちゃんと再現がとれるか確認中です． そして，今日再現がとれませんでした． 原因は見当がついて…