長女は小学6年生になり、受験めがけてまっしぐらです。 ある日、そんな彼女が書斎に入ってきていいました。 「今度、相談させてもらいたいことがあるんだけど、時間とってもらえるかな？」 長女から声をかけられ、私達両親と彼女とで …
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CCR5は、記憶同士をリンクする時間枠の窓（temporal window）を閉じる
記憶の形成というのは色々と複雑な機序が絡み合っているという印象がありますが、「最初に入ってきた記憶が、そのちょっと後に入ってきた記憶の整理に影響する」というのは、私達の実社会でもなんとなく実感が湧くと思います。 マウスで …
うちの夫は、子どもたちに何か注意する時、 「ちょっと、Mr !」 と言うのが口癖で、それに対して子どもたちは決まって、 「ミスターじゃないよ。僕／私の名前は○○だよ！」 と反論しています。 だいたい長女（9 …
【R Markdown】外部スクリプト等をチャンク内で読み込む
RMarkdownは多機能だけど、内容が増えたら、コードを外部の.rmdファイルや、他の.rファイルなどに配置し、チャンクで読み込むようにした方がなにかと便利。 見た目が簡潔になるし、Rコードのデバック等も、Rスクリプト …
この記事を読むほとんどの人には関係ないと思うけど、ほぼほぼ自分の為だけに備忘録。 ラボにある古い古いヒートマップアプリのテンプレ画像をイラレで作る際、なぜか自宅PCにインストールしている illustrator CC で …
先日、"彼ら" を意味する "they/their/them/theirs" が、単数の人を指すときの代名詞として使える事を知りました。 普段から使っている人達には常識かもしれませんが、私的には目からウロコだったので、こ …
列A、列B、列C...の各行毎に平均値を出して、それぞれ新しい列に結果を追加する方法3つ。 個人の練習も兼ねて前後の工程も記載しているので、あしからず。 事前準備 データの取り込み 人からもらった、とあるデータを取り込む …
私の実家では、小さな頃から何かしらのペットを飼っていました。 金魚、亀、文鳥ファミリー、ハムスター、犬2匹、猫2匹……。 みんな人間よりも短命なので、子供の頃から、彼らが天寿を全うしたり、突然命が絶たれたりするのを見てき …
RMarkdownで記述→knit→記述→knit...という作業を行っていくけれど、 ちょっとした所をプレビューで確認したいだけなら、毎回 knit しなくても、ビジュアルモードに切り替えるだけで事足りる場合も多い。 …
黒質ドパミン神経細胞の中でも、パーキンソン病で特にやられやすいサブタイプ
パーキンソン病（Parkinson's disease, PD）は、黒質緻密部（substantia nigra pars compacta, SNc）のドパミン（DA）神経細胞が障害され、それに伴って振戦・固縮・動作緩 …
他の人の原稿を添削する時によく気になるのが、「スペルチェック」のnotificationを無視している事。 例えば以下のような原稿。 "amylacea" という単語の下に赤の波線が引かれていて、「スペルミスじゃないで …
先日、ラボの一人が製薬会社にポストを得て異動する事が決まりました。 彼はアメリカ人なのですが、なんというか、典型的な "デキる" タイプの方のアメリカ人だったので、 建設的な話し方や人々への配慮の仕方など、私はこっそり参 …
【Rで統計】一元配置分散分析：One-way factorial ANOVA
2群比較はt検定。 3群以上の比較は分散分析（Analysis of variance, ANOVA）。 分散分析の前提条件は下記3点。 N数が十分に多い 分散が等しい 正規分布 分散はBartlett検定 …
先日、TDP-43の凝集体はアミロイドフィブリル状の構造をしておらず、もっとグチャッとしている……のような内容の論文 [1] について考察しましたが、 それに関連して……今回は、TDP-43のC末断片（TDP-25）凝集 …
【Illustrator】Dot-density map を作成し、Heatmap と重ねる
先日、ハーフトーンでスケールを作る方法を書き留めたばかりだけど、 私の持っている heatmap アプリがハーフトーンのスケールを認識しなかった（まあ、あたり前かもだけど……）。 で、結局グレースケールで一度ヒートマップ …
少し前に "Six Flags" というテーマパークに遊びに行った時の話。 絶叫系アトラクションをはしごした後、私達は観覧車でひとブレイク入れることにしました。 遠くに見える観覧車を目指して歩いていると、次 …
以前パズルブームだった長女（当時7歳）。 その時は、動物、宇宙と1000ピースのパズルを完成させ、「次は1500ピースの花火にする！」と張り切ってとりかかりましたが、 ちょっとハードルが高かったらしく、完成を見ずして、子 …
【RMarkdown】word文書をMarkdown形式に変えてRに取り込む
RMarkdown → Wordだったら、アウトプット形式をwordに変えてknitすれば良いけど、 今回は、 一度wordで出力して、色々編集した後にもう一度RMarkdownに取り込みたい 誰かが作ったword文書を …
α-シヌクレイン（α-synuclein, α-Syn）は、パーキンソン病（Parkinson's disease, PD）やレヴィ小体型認知症（dementia with Lewy bodies, DLB）の主要病理で …
Heatmapのテンプレート作成中。 ドット模様のスケールが必要になったので、その備忘録。 ドット模様（ハーフトーン）を作る グラディエントの図を作成 まずは、グラディエントの図形を作成する。 「M」（もしくは、ツールバ …
ちょっと前の話になりますが、隣の席の韓国人の同僚が、祖国で教授のポジションを得て、急遽帰国することになりました。 彼は私達夫婦と同じ脳神経内科医で、韓国で患者さんを診ながら臨床研究でたくさん業績を出していたのですが、 「 …
先日、htmlアウトプットのスタイル変更について書いたので、 今回はwordアウトプットのスタイル変更について。 htmlの場合はスタイルのcssファイルを作ってそれを参照するようにしたけど、 wordの場 …
アルツハイマー病では、神経細胞の遺伝子がより多く変異している
私達は、普段何気なく生活しているこの瞬間にも、どこかの体細胞の遺伝子が傷つき、損傷と自己修復を繰り返しています。 増殖抑止機能の部分の遺伝子修復が追いつかなかったりして、自己増殖能がイカれた細胞の一部はがん細胞として独り …
まあ、言ってしまえばただの消しゴムなんだけど、あたかも鉛筆で書いた線を消しゴムで消すかのように消して、ベクターを再編成してくれるから、魔法みたいだなーと思う。 消しゴムツール 例えば下記のような線の余計な部分を消したい場 …
先日の長女（9歳）との会話を受けて、 私は 「やっぱり彼女は、自分の作った作品を皆に見てほしいんだなー。」 と思うようになりました。 彼女は、絵本や漫画以外にも、たくさんの絵を描いています。 出来上がった作 …
【RMarkdown】htmlアウトプットにカスタマイズのCSSスタイルを適応
RMarkdownを英語だけで使っていた時は規定のスタイルで気にならなかったのだけれど、 先日、日本語を使ってみたら、英語と日本語のフォントで明らかな差があったり、大きさのバランスが悪くて気になったので、CSSをカスタマ …
ジワジワと進展してきたタウが下前頭回でAβと出会った時、新皮質への爆発的広がりの扉が開く
私が研究を始めた頃、アミロイドβ（amyloid beta, Aβ）がアルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）の根本的原因とする「アミロイド仮説」が全て、のような雰囲気がありました。 「Aβが溜 …
Heatmapのテンプレづくりに欠かせないライブペイント。 私の使っているHeatmapアプリでは、アトラスの各領域をソフトに認識してもらうために、グレースケールで領域を指定したテンプレートを作っておく必要がある。 ライ …
長女（9歳）は、不定期に自分で絵本や漫画を作っており、 出来上がると、私達両親に見せに来ます。 いずれのお話も、長女の頭の中に浮かんだストーリーを浮かんだままに書かれている感じで、色々な意味で独創的です。 …
【Rデータ整理】欠損値（NA）の取り扱い③：他のデータから予測し補完する
NAの取り扱いシリーズ第3段。 今回は、他のデータから予測できる場合にその情報を使って補完する方法。 他のデータを使って補完 例えば下記のようなデータフレームがあった場合、 "State" が<NA& …
ナイアシン受容体のHCAR2がミクログリアを活性化し、ADに保護的に働く
ビタミンB群が神経保護的に働く事は時々聞きますが、その中の1つであるナイアシンは、ビタミンB3に該当し、ニコチン酸（nicotinic acid）とニコチンアミド（nicotinamide）の総称になります。 ニコチン酸 …
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長女は小学6年生になり、受験めがけてまっしぐらです。 ある日、そんな彼女が書斎に入ってきていいました。 「今度、相談させてもらいたいことがあるんだけど、時間とってもらえるかな？」 長女から声をかけられ、私達両親と彼女とで …
「お母さん、買ってほしいものがあるんだけど……。」 ある日、長女が相談にきました。 彼女の買ってほしいものとは……ミシンでした。 ミシンをアメリカに置いてきた アメリカから日本に引っ越すとき、ミシンは輸送費カットのために …
春休み。 長男は中学でたくさんの宿題が出ました。 春休みの勉強スケジュールを立てる 夏休みも冬休みも大量の宿題を抱えながら、休み期間中に全く手をつけず、最終日に泣く泣く机に向かっていた長男。 3度目はないようにと、私達両 …
次男（8歳）は、最近、鏡の前で時間をかけて髪をセットするようになりました。 髪の毛に水をつけて、キリッと立ててみたり、ペタンと流してみたり…… 満足のいく髪型ができると、家族に見せにきます。 「どう？かっこよく見える？」 …
周囲がAMEDやらムーンショットやらの申請書作成でバタバタしている今日この頃、 私はもう一つ、別のものとも戦っています。 ―― お弁当です。 長期休みはお弁当シーズン 春休みに入り、小学生2人の給食は一時休業。 これまで …
ある日の事、長女と次男が戸棚をゴソゴソ物色していました。 本棚のあまりの目板を引っ張りだし、DIYセットを使ってトンカチトンカチ……。 「何を作っているの？」 と尋ねると、 「次男くんの机を作って上げてるの …
運動によって脳が健康になることはこれまでも何回か取り上げてきました [1, 2, 3, 4] もちろん、脳だけでなく、体全体を張り巡らしている「血管」自体の健康も促す事は周知の事だと思います。 今回、アメリカ・カリフォル …
ある金曜日の夜、晩ごはんを食べようとみんなで席についたところで、に学校の先生から電話がかかってきました。 「今からお宅に伺ってもよろしいでしょうか？」 担任の先生の来訪 先生の話によると、本日、学校のクラスで次男とお友達 …
ストレス社会と言われる現代。 テレビでも、ストレスでうつ病になったり、病気に罹りやすくなったりする人達の特集が組まれているのをよく見かけます。 でも、なぜストレスで心と体にこんなにも影響が出るのでしょうか？ アメリカ・マ …
アミロイドβ (Amyloid beta, Aβ) のオリゴマー、フィブリルなどの集合体には神経毒性があり、シナプス障害を引き起こし、認知機能低下に繋がる事が示唆されています [1] 。 また、Aβがあると、神経活動が異 …
ある日の事、家事代行サービスの特集をしていたテレビ番組を見て、夫が言いました。 「うちも家事代行サービスを利用してみたらどうかな？」 最近の家事代行サービスは凄いらしい 特集されていた家事代行サービスでは、冷蔵庫の中の食 …
我が家で魚たちの中で最も元気なのは、カワムツです。 近所の川でたくさん泳いでいて、昔はこのあたりの人達は普通につかまえて天ぷらにして食べていたとか。 観賞用に開発された金魚達とは違い、野生の魚達の持つ、すばしっこさとパワ …
ある日の事、次男（小2）が、ちょっとうつむき加減で話してきました。 次男「あのね。僕ね、先生から嫌われちゃったみたいなんだ。」 私「なんで？」 次男「授業で僕が発表してたら、先生から『話の ”ほうこうせい” を変えないで …
川の生き物達のために、川底の砂をごっそり採取し、各水槽の底面に敷いたところ、エビや川ヨシノボリ達は、たいそう喜び、砂を食べたり、石の下の砂底を掘って寝床を作ったりして過ごしています。 「川底の砂を持ってきてよかったね。」 …
長女（小5）と次男（小2）は、小学校で音読の宿題があります。 毎日、国語の教科書を広げ、授業を受けているお話を大きな声で読んでくれます。 長女の現在のお話は、「大造じいさんとガン」。 リンク 次男のお話は、「スーホの白い …
「アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) のタウやパーキンソン病 (Parkinson's disease, PD) のα-シヌクレイン (α-synuclein, α-syn)が、プリオン …
長男（中1）には、L君という、顔も名前も知らない兄貴……的なお友達がいます。 彼は今もアメリカに住んでいるハズですが、なぜか長男が日本（時差は14時間）でゲームをしようとオンラインに繋ぐと、かなり高い確率で彼もそこにいる …
去年秋に職場が変わり、自宅から特急電車で通勤しています。 この生活になってから、定期券を無くしたり、電車に乗り遅れたりと、時にヒヤリハットな事態に見舞われていますが……先日は、通勤時間の最長記録という、不名誉な記録を更新 …
うちには現在、魚の水槽6槽の他、ゴーヤやフウセンカズラなどの植物をリビングで育てています。 学校で「生き物係」をしている長女（小5）は、自宅でもやっぱり「生き物係」。 冬は植物たちを少しでも暖かくしてあげようと、彼女は、 …
2月3日は節分の日。 私達の住む地域では、あちらこちらの神社で節分祭を開催しています。 「せっかくだから、今年は節分祭に行ってみよう！」 「金魚すくいの屋台があったら、サケちゃん達のお友達をゲットしよう！」 とゆーことで …
以前、Nintendo Switch と太鼓の達人を買ってもらうためのプレゼンの準備をしていた長男 (12歳) と、それを阻止するためのプレゼンの準備をしていた長女 (10歳)。 それぞれ、ネットで調べた情報等を元に、ス …
MACアドレスとは MACアドレスは、Media Access Control Address の略。 ネットワークのつながる全ての機器に割り当てられている識別番号で、イーサネットや無線LANなどに接続されているノードを …
我が家のお小遣いは、報酬制にしています。 「食器洗い50円、お風呂掃除30円、洗濯物30円……」 という感じ。 単価は子供達と一緒に決めました。 下の子2人には好評 お小遣いの報酬制については「お手伝いがお金目的になって …
他の人からデータを送ってもらうとき、 「このデータ送りたいけど、容量が大きすぎて、拒否られちゃうよ。」 と言われた時、NAS にアップロードしてもらうと便利。 Synology にファイルをアップロードしてもらう方法 リ …
RStudio Server を利用したくなったけれども、RStudio Server で必要な OS は Linux。 なので、仮想マシンに Linux distributions の何かを入れて、そこに RStudi …
スキャナイメージデータなどは容量がものすごく大きくなるので、私は NAS に保存するようにしている。 個人的には、サブスクリプション不要の位置づけ。 で、今回は、NAS のデータを他の人と共有する方法のメモ。 Synol …
外部からインターネットを通してリモート接続したい場合、WAN（Internet）側IPアドレスにはグローバルIPアドレスが割り振られる必要がある。 けれども、CATVやマンションなどのインターネットサービスで、割り振られ …
「お母さん、僕、これを作ってみたい！」 ある日、次男(7歳)が部屋に入ってきて、スマホの画面を見せてきました。 画面に写っていたのは、平野レミさんのレシピが載っているサイト。 「さっき、テレビでやってたの。すごく簡単だっ …
リモートデスクトップ等の時、ホストPCがスリープになっちゃうとリモート接続できなくなる。 ……ので、それを防ぐ設定をしておくべし。 スリープにならないように設定する 長時間作業をしていないと、省エネのためにディスプレイ画 …
Hyper-V に Ubuntu 22.04 LTS を入れて RStudio Server を利用していたけど、SSH のところで引っかかって、手元の Laptop PC から繋げなくなったりした。 ネット上のトラブル …
先日、Ubuntu 22.04 LTS で固定IPアドレスの設定を行ったけれど、 私が使用している Ubuntu Desktop版ではGUIベースでもっと簡単に設定できることがわかった……ので、せっかくなのでメモっておく …
先日、羊毛を使って3匹の子猫のぬいぐるみを作った長女 (10歳)。 すっかり自信がついたようです。 「あのね、もうすぐおじいちゃんとおばあちゃんのお誕生日だから、プレゼントにシュリとココちゃんのぬいぐるみを作ってあげよう …
今使用している Ubuntu 20.04 LTS のデスクトップ版で固定IPアドレスを設定する方法。 Ubuntu デスクトップは、デフォルトでDHCPサーバーから取得したIPアドレスが自動設定されるため、再起動すると別 …
Ubuntu 22.04 LTS で固定IPアドレスを設定しようとした時、gateway4に対して下記警告が。 ** (generate:XXXX) WARNING ** XX:XX:XX.XXX:`gateway4` …
先日、長男 (12歳) の中学の入学式がありました。 入学式の朝 「お母さん、僕のネクタイ、なんか変じゃない？」 入学式の朝、長男は初めて自分でネクタイをつけました。 春休みに何回か練習しましたが、やはりまだ一人では綺麗 …
リモート接続する時、 下記表示が出て、正しいはずのユーザー名とパスワードを入力してもブロックされた。 で、困って色々試行錯誤した時のメモ。 Credentials Manager を再設定 時々、ネットワークが rebo …
個人情報などをぼかす時、Blurツールを使って手動でやってたけど、 なかなか手間なので、これをBoxでBlurを作る方法の覚書。 Boxでぼかす方法 まず、レイヤーを選択し、Ctrl + J でレイヤーを複製。 Filt …
ある日の事、次男 (7歳) が折り鶴をたくさん折っていました。 1つ、2つ、3つ……どんどん作っていきます。 「そんなにたくさん鶴を折ってどうするの？」 次男に聞いてみると、彼は手を休めずに言 …
Ubuntu で、現在のポートの状態を確認するコードは、 ufw status。 $sudo ufw status Status: active To Action From -- ------ ---- 22/tcp …
リモートアクセスなどで、特定のポートのみファイアウォールでブロックされないようにする方法。 使用している OS は Windows 11。 コントロールパネル > システムとセキュリティ > Windows …
